IGV(Interactive Genomic Viewer)是一款功能强大的基因组数据可视化工具,适用于分析DNA测序结果、基因注释和变异调取。以下是快速上手指南:


📚 快速入门

  1. 安装
    下载最新版本:点击此处获取IGV安装包

    • 支持Windows/Linux/macOS系统
    • 安装后启动程序,界面如图:
      IGV界面
  2. 加载数据

    • 点击 FileLoad From File 选择BED/BAM/VCF文件
    • 支持格式:
      • 🧬 FASTA基因组序列
      • 🧬 BED注释文件
      • 🧬 BAM比对文件
  3. 交互操作

    • 使用 Search 框快速定位基因区域
    • 鼠标滚轮缩放,点击区域查看详细信息
    • 示例操作截图:
      IGV操作示例

🧬 功能详解

  • 基因组浏览
    实时显示染色体、基因位置及变异信息
    查看更多高级功能

  • 变异调取
    支持SNV、Indel、SV等变异类型标注

    • 点击 ViewTrack Settings 自定义显示参数
  • 数据共享
    可将分析结果导出为图片或PDF

    • 导出格式:PNG, SVG, PDF

📌 常见问题

  • ❓ 如何解决加载文件失败?
    检查文件路径是否正确,确保文件格式兼容

  • ❓ 如何批量处理多个样本?
    使用 FileLoad Multiple Files 功能

  • 🔍 需要帮助?
    查看官方文档:IGV使用手册中文版


📈 示例数据

点击展开示例数据集
文件类型 示例链接
BAM文件 /数据/示例BAM
VCF文件 /数据/示例VCF

🌐 扩展阅读


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