IGV(Interactive Genomic Viewer)是一款功能强大的基因组数据可视化工具,适用于分析DNA测序结果、基因注释和变异调取。以下是快速上手指南:
📚 快速入门
安装
下载最新版本:点击此处获取IGV安装包- 支持Windows/Linux/macOS系统
- 安装后启动程序,界面如图:
加载数据
- 点击
File
→Load From File
选择BED/BAM/VCF文件 - 支持格式:
- 🧬 FASTA基因组序列
- 🧬 BED注释文件
- 🧬 BAM比对文件
- 点击
交互操作
- 使用
Search
框快速定位基因区域 - 鼠标滚轮缩放,点击区域查看详细信息
- 示例操作截图:
- 使用
🧬 功能详解
基因组浏览
实时显示染色体、基因位置及变异信息
查看更多高级功能变异调取
支持SNV、Indel、SV等变异类型标注- 点击
View
→Track Settings
自定义显示参数
- 点击
数据共享
可将分析结果导出为图片或PDF- 导出格式:PNG, SVG, PDF
📌 常见问题
❓ 如何解决加载文件失败?
检查文件路径是否正确,确保文件格式兼容❓ 如何批量处理多个样本?
使用File
→Load Multiple Files
功能🔍 需要帮助?
查看官方文档:IGV使用手册中文版
📈 示例数据
点击展开示例数据集
文件类型 | 示例链接 |
---|---|
BAM文件 | /数据/示例BAM |
VCF文件 | /数据/示例VCF |
🌐 扩展阅读
- 📘 IGV官方教程(英文)
- 📘 基因组数据分析入门
- 📌 IGV用户手册PDF下载
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