GROMACS 文档介绍

GROMACS（Groningen Machine for Chemical Simulations）是一款开源的分子动力学模拟软件，广泛用于生物分子系统的研究。以下是对GROMACS文档的简要介绍。

获取文档

您可以在GROMACS官方文档中找到详细的文档和指南。

安装指南

安装步骤

1. 下载GROMACS：从GROMACS官网下载适用于您操作系统的GROMACS版本。
2. 配置环境变量：根据您的操作系统配置GROMACS的环境变量。
3. 编译与安装：按照安装指南完成编译和安装过程。

使用示例

以下是一个简单的GROMACS模拟示例：

gmx grompp -f topol.tpr -c eq.rst -p topol.pdb -o md.tpr
gmx mdrun -deffnm md

这些命令会准备模拟系统，并开始进行分子动力学模拟。

扩展阅读

如果您想深入了解GROMACS，以下是一些推荐的资源：

• GROMACS官方文档
• GROMACS用户论坛

希望这些信息对您有所帮助！