分子动力学是一种模拟分子和原子在热力学平衡状态下运动的方法。它广泛应用于化学、物理学和生物学等领域。以下是一些关于分子动力学的基本概念和教程资源。

基本概念

  • 力场：描述分子间相互作用的势能函数。
  • 时间步长：模拟中分子运动的时间间隔。
  • 温度控制：保持系统在特定温度下运行。

教程资源

  • MD教程网站：MD教程 - 这里提供了详细的分子动力学教程，包括理论背景和实践操作。
  • 力场介绍：力场列表 - 了解不同类型的力场及其应用。

实例分析

以下是一个简单的分子动力学模拟实例：

  • 模拟对象：水分子
  • 力场：TIP3P
  • 温度：298K
  • 时间步长：1 fs

通过分子动力学模拟，我们可以得到水分子的运动轨迹和能量变化。

图片展示

Water_Molecule

MD_Simulation

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