Ensembl 是一个综合性的基因组数据库,提供了一系列关于基因组、转录组和蛋白质组的数据。它是由欧洲生物信息学研究所(EBI)和 Wellcome Sanger Institute 共同维护的。

主要功能

  • 基因组注释:提供基因组序列、基因定位、基因结构和功能注释。
  • 转录组数据:提供基因表达数据,包括RNA-seq、EST和GEO数据。
  • 蛋白质组数据:提供蛋白质结构、功能和变异信息。
  • 变异数据库:提供人类和模式生物的基因变异信息。

数据查询

您可以通过Ensembl的Web界面或API进行数据查询。以下是一些常用的查询方法:

  • 基因组浏览:通过基因组浏览器查看基因结构、转录本和变异信息。
  • BLAST:使用BLAST工具进行序列比对。
  • 变异搜索:搜索特定基因或基因区域的变异。

扩展阅读

如果您想了解更多关于Ensembl的信息,可以访问以下链接:

图片展示

Ensembl基因组浏览器截图

Ensembl基因组结构