Clustal Omega 使用教程 🧬

Clustal Omega 是一款用于多序列比对的生物信息学工具，广泛应用于基因组学和蛋白质结构分析。以下是快速上手指南：

安装与配置 🛠️

1. 下载：访问 Clustal Omega 官方网站 获取最新版本
2. 安装：
   • Linux: sudo apt install clustalo
   • Windows: 下载安装包并按提示操作
   • macOS: 使用 Homebrew brew install clustalo
3. 验证：运行 clustalo --version 确认安装成功

基础用法 📁

clustalo -i input.fasta -o output.aln

• -i 指定输入文件
• -o 指定输出文件
• 支持格式：FASTA, CLUSTAL, PHYLIP 等

高级功能 🔍

• 并行计算：添加 --threads 4 参数加速处理
• 自定义参数：
  • --gapopen 10 设置缺口开放罚分
  • --gapextend 0.1 设置缺口延伸罚分
• 可视化：比对结果可通过 BioPython 工具 进一步分析

常见问题 ❓

• Q: 如何处理大规模序列？
  • A: 使用 --full 参数启用完整比对模式

如需深入了解，可参考 Clustal Omega 官方文档 或 多序列比对原理。