Blast（Basic Local Alignment Search Tool）是一种用于生物信息学中序列比对的工具，它可以帮助我们快速找到数据库中与我们的序列最相似的序列。以下是一些关于blast参数实战的教程内容。
常用参数介绍
-query：指定查询序列文件-db：指定数据库-out：指定输出文件-outfmt：指定输出格式-evalue：指定期望值，用于过滤结果-word_size：指定匹配词大小
实战案例
假设我们要将一个DNA序列文件query.fasta与NCBI的nr数据库进行比对，输出格式为XML，期望值设置为1e-5，输出文件为result.xml。
blastn -query query.fasta -db nr -out result.xml -outfmt 5 -evalue 1e-5
扩展阅读
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